ANALISIS FILOGENETICO CON DATOS MOLECULARES
Curso Optativo en el Posgrado de Ciencias Biológicas, Instituto de Biología
Semestre 2009-1
programa [pdf]
lecturas 15 de Octubre - 21 de Noviembre [pdf]
lecturas 3 de septiembre - 8 de Octubre
PAUP ejemplo 1: taxa, caracteres y matrices de distancia
PAUP ejemplo 2: búsquedas exactas y árboles
PAUP ejemplo 3: búsquedas aproximadas
PAUP ejemplo 4: parsimonia con pesos
Profesores
Dra. Susana Magallón Puebla, Departamento de Botánica, Instituto de Biología, 3er Circuito de Ciudad Universitaria, Del. Coyoacán, México D.F. 04510. Tel. 5622-9087, s.magallon@ibiologia.unam.mx.
Dr. David Gernandt, Departamento de Botánica, Instituto de Biología, 3er Circuito de Ciudad Universitaria, Del. Coyoacán, México D.F. 04510. Tel. 5622-9080, dgernandt@ibiologia.unam.mx.
M. en C. Laura M. Márquez Valdelamar, Laboratorio de Biología Molecular, Instituto de Biología, 3er Circuito de Ciudad Universitaria, Del. Coyoacán, México D.F. 04510. Tel. 5622-9073, lmarquez@ibiologia.unam.mx.
Requisitos
HABER APROBADO SISTEMATICA I, O UN CURSO DE SISTEMÁTICA EN POSGRADO EQUIVALENTE.
Para la sección de laboratorio: Estar desarrollando un proyecto de investigación que incluya el análisis de secuencias de DNA o haber definido el grupo de estudio, identificado el marcador molecular y contar con los iniciadores (oligos o primers) que utilizará. Para la sección de análisis: Tener acceso a equipo de cómputo y programas para obtención, edición y alineamiento de secuencias moleculares, y realización de análisis filogenéticos. La mayoría de los programas que se utilizarán en clase son de distribución gratuita.
NUMERO MAXIMO DE ESTUDIANTES: 10.
Número de sesiones y horas/semana
96 horas en 32 sesiones durante 16 semanas (6 horas por semana; El primer mes diario de 10:00 a 14:00 en el Laboratorio).
Horario
Agosto 11 a Agosto 27 : Sección de Laboratorio: Diariamente.
Septiembre 1 a Noviembre 28: Sección de Análisis: Lunes, Miércoles, y algunos Viernes de 10:00 a 12:00 hrs.
PRESENTACION DEL CURSO: Lunes 11 de Agosto, 10:00 hrs., Aula 1 de Posgrado, Instituto de Biología.
Lugar
Instituto de Biología, UNAM. Sesiones de laboratorio: Laboratorio de Biología molecular (1er piso, Edificio B). Sesiones de análisis: Aula 1 y Sala de Cómputo de Posgrado (Planta Baja, Edificio C).
Descripción del curso
Objetivos: Que los alumnos manejen los principales métodos de laboratorio y técnicas de análisis para obtener hipótesis filogenéticas con base en secuencias moleculares.
El curso incluye una sección de laboratorio, en la que se impartirá la teoría y la práctica para la obtención de secuencias moleculares, y una sección de análisis, en la que se impartirán la teoría y el uso práctico de programas para el manejo y análisis filogenético de datos moleculares. En el curso se enfatizarán tanto fundamentos y conceptos teóricos, como la práctica en el laboratorio y en la computadora.