Ejercicios de Compu

Edición y alineación de secuencias


BioEdit

GenBank

BLAST y MAFFT


PAUP*

Ejemplo 1: taxa, caracteres y matrices de distancia

Ejemplo 2: búsquedas exactas y árboles

Ejemplo 3: búsquedas aproximadas

Ejemplo 4: parsimonia con pesos

Ejemplo 5: prueba de Templeton y PHT

Ejemplo 6: métodos de distancia

Ejemplo 7: máxima verosimilitud

Ejemplo 8: apoyo de ramas

PAUP demostración: búsquedas heurísticas, bootstrap y un análisis de distancia

PAUP demostración: manejo de taxa y caracteres y búsquedas exactas


TNT

Matriz de rbcL para las plantas con semilla

 

MODELTEST

Modeltest

jModelTest

 

MÁXIMA VEROSIMILITUD

Garli-primates

Garli-coníferas

Atracción de ramas largas entre plastomas de gimnospermas

 

INFERENCIA BAYESIANA

MrBayes

BEAST

Estimaciones de edades absolutas en pináceas