Inferencia Filogenetica
Curso Optativo en el Posgrado de Ciencias Biologicas.
Instituto de Biologia
Semestre 2009-2
Profesores
Dr. Francisco Vergara Silva, Jardin Botanico, Instituto de Biologia
tel. 5622-8978, fvs@ibiologia.unam.mx
Dr. Gerardo Salazar Chavez, Departamento de Botanica, Instituto de Biologia
tel. 5622-9095, g.salazar@ibiologia.unam.mx
Dr. David Gernandt, Departamento de Botanica, Instituto de Biologia
tel. 5622-9080, dsgernandt@gmail.com
Requisitos
Estar inscrito en el Posgrado de Ciencias Biologicas o en un posgrado equivalente.
Tener acceso a equipo de computo y programas para obtencion, edicion y alineamiento de secuencias moleculares, y realizacion de analisis filogeneticos. La mayoria de los programas que se utilizaran en clase son de distribucion gratuita.
Numero maximo de estudiantes: 12
Horario
64 horas en 16 sesiones (4 por semana)
Febrero 5 a Mayo 28
Jueves de 10 a.m a 2 p.m.
Instituto de Biologia, UNAM
Aula 3 y Sala de Computo de Posgrado, Planta Baja, Edificio C
Evaluacion
1. 15 resumenes de una cuartilla sobre el tema de la semana (30%)
2. Dos presentaciones de 45 minutos (40%)
3. Participacion
4. Examen global (20%)
Contenido
1. 5 de febrero. Presentacion del curso. DG/FV
2. 12 de febrero. Introduccion. FV
3. 19 de febrero. Homologia. FV
4. 26 de febrero. Caracteres. FV
5. 5 de marzo. Polarizacion de caracteres. FV
6. 12 de marzo. Busquedas exactas y heuristicas. DG
7. 19 de marzo. Optimizacion de caracteres y medidas de su comportamiento. DG
8. 26 de marzo. Evaluacion de resultados I: procesos de aleatorizacion. DG
9. 2 de abril. Evaluacion de resultados II: Arboles de consenso. DG
10. 16 de abril. Metodos de distancia. DG
11. 23 de abril. Analisis separado y simultaneo. GS
12. 30 de abril. Modelos de evolucion de caracteres. GS
13. 7 de mayo. Maxima verosimilitud. GS
14. 14 de mayo. Inferencia Bayesiana. GS
15. 21 de mayo. Probando hipotesis con parsimonia y verosimilitud. GS
16. 28 de mayo. Examen global.